氨基酸平衡在必需氨基本各組分間以及在必需氨基酸與非必需氨基本各組分間也具有重要意義。尤其是必需氨基酸供給不足時，氨基酸平衡更為重要。
當食品或飼料中蛋白質氨基酸各組分間的相對含量與人或動物體氨基本需要量之間的相對比值一致或很接近時，氨基酸各組分間的相互關係平衡時，氨基酸利用率最高。
飼料蛋白質是水產動物所需要的重要營養素之一，而蛋白質利用的本質是氨基酸組成的比例和數量，特別是必需氨基酸的比例和數量，與動物自身組成越一致，其質量越高。飼料種各種氨基酸的數量和比例要符合動物生理需要，而不是越多越好。某種氨基酸過剩，即超過再合成蛋白質要求界限時，其多餘的氨基酸，將通過脫氨基作用被當做能源利用，或作為體脂的原料而被蓄積起來。
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