劉基自從洪武4年辭職歸裡之後，就一直安養在老家浙**田，他深知檢校無處不在，而朱元璋猜疑之心更從無停止，為了證實自己完整拋卻朝廷之事，他歷來不見本地**。有一次，青田知縣以平民身份去見他，以及他相談甚歡，分別之時說自己是青田知縣，對老師敬慕已經久才來拜見，劉基一聽立時下跪，口稱小民，並從此再不見客，其幽居如是——可饒是他這么謹慎小心，但卻仍沒辦法跳出混亂世事。
浙江以及福建交壤處有一個叫談洋之處，這地方離劉基的故鄉不遠，他不肯意這裡不服王化，一貫被鹽梟所盤踞，就向朱元璋奏請設立巡檢司進行統領。鹽梟不服，聚眾作亂，劉基派大兒子劉璉將寫清這件工作原委果奏章帶到京師，沒有經由中書省，而是直接送到了朱元璋的手裡。劉基是聰慧人，他知道胡惟庸以及自己一貫紕謬付，假如通過正常渠道，朱元璋頗有可能看不到這份奏章——中書省有權在天子以前先拆看大臣的奏章，假如落到胡惟庸手裡，這份檔案確定會被扣留在中書省內。劉璉此時尚無功名，只是一介平頭庶民，他隻身來到南京城，怎樣能把奏章交到天子的手裡呢？大概是劉基過去認識的檢校從中幫的忙吧。
但是胡惟庸立時知道了這件事——也不知哪位檢校的功勳。繞過中書省直接向天子上書，這件事對於新官上任的中書執掌人來講，其實是太難看了，於是新仇舊怨一齊湧上胡惟庸的心頭。胡惟庸連忙指使刑部尚書吳雲上書**劉基：「劉基曾經說談洋這個地方有王氣，他看中了，想身後把墓建在這裡，本地庶民不願讓地，這才要求朝廷設立巡檢司驅趕庶民，好拿到這塊好地方。」——說看中一個地方有王氣而把墓建在那邊，這是封建時期對一個臣子最大的誣告方法之一，王氣只能天子本人有，做臣子的圖謀這個便是要造反啊。前人迷信得很，祖宗墳地建在**是會影響子孫昆裔的大事，而王氣這類東西來無影去無蹤，倒是誅心之論——你劉基不是以能掐會算出名嗎？咱們就用你拿手的寶貝來坑你，何況這類玄而又玄的東西你還真不好辯護。
朱元璋不愧為一代雄主，他儘管也敬天祭天，但並不是一個絕對迷信的人，昔時李善長之所以能得到他的信重，不是由於說自己的老家以及漢高祖劉邦的老家離得近所以有王者之氣，而是李善長應用劉邦的故事鼓勵了自己的緣故。因而朱元璋看到奏章後並無如胡惟庸所願的那樣按造反罪拘捕劉基，固然，這類工作也不可能完整無視，於是意味性地處以了奪俸的處分。但劉基在老家卻坐不住了，他掉臂老病之軀，千里迢迢趕到南京城，向朱元璋當面謝罪。
這一下羊入虎口。
劉基進京以後就病倒了，這一病經年，而胡惟庸並無忘懷他，也不會就此放過他。聽說胡惟庸曾經派大夫到劉基那邊去看病，劉基吃了大夫開的藥，「有物積腹中如拳石」，反而致使病勢加劇。到洪武八年3月的時候，這位能掐會算的劉伯溫老師已經經到了油盡燈枯的境地，朱元璋派人護送他返鄉，昔時4月，他就死在了自己的故鄉。
這一番爭鬥，朱元璋只在一旁看著，胡惟庸上躥下跳的演出在他看來以及小丑沒甚么兩樣。此時的朱元璋，心裡已經經慢慢有了改組中書省、廢止宰相軌制的設法，但如此大動作非得有人祭血才行。胡惟庸做中書右丞相之後，收納賄賂、隨意率性處罰**、扣留奏章都是有的，但靠這些痛處來定他的罪，份量還嫌不夠。
儘管也有人**胡惟庸，但朱元璋不僅不去追究，反而將這樣的**交給胡惟庸自己處理——朱元璋親點的狀元吳伯宗時任禮部員外郎，舉朝迎合胡惟庸的時候，他腦子10分甦醒，始終不願阿附，不但如此，還向朱元璋上疏密告胡惟庸的種種造孽行動。胡惟庸一怒之下把他貶了官，差點沒把他整死。
到了洪武9年(1三七6年)的時候，胡惟庸在右丞相的地位上已經經坐了3年。而朱元璋恍如是為了讓他更好地擅權似的，這一年，中間當局吊銷了中書省體例中的平章政事以及參知政事這兩個職位——平章政事便是副宰相，雖然說多年空白，地位此前可一直沒有廢止。同時，在地方上廢止了元代履行的行中書省軌制，改由承宣告政使司擔任地方行政主座，直接向中書省負責。原本在中書省的體例中，左、右丞相最高，其下分別為平章政事，左、右丞以及參知政事，現在廢止了平章政事以及參知政事的職位，中書省只剩下了左、右丞相以及左、右丞的體例，其下儘管增設了幾個以及地方布政使司相聯絡的地位，但無非是輔助丞相罷了。這一來，胡惟庸在中書省，進而在整個大明代，均可以說是取得了真正出言如山的權利。
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